1. Probiotiki zahtevajo dolgoročno in stalno dopolnjevanje. Okolje človeške črevesne flore se bo spremenilo s prehrano in telesnim stanjem. Občasno dodajanje probiotikov ne more ohranjati črevesne flore v odličnem stanju dolgo časa. Zato je primerno dolgotrajno jemanje probiotikov bolj učinkovito za alergike. Ima velike prednosti. Lahko ublaži alergijske simptome, izboljša alergijsko konstitucijo od znotraj navzven in zmanjša pojavnost alergij.
2. Vloga dolgoročnega kvantitativnega probiotičnega dodatka je povečati število in širjenje črevesnih probiotikov.
3. Probiotiki morajo prestati test želodčne kisline in žolčnih soli, preden pridejo v tanko črevo. Če torej ne gre za probiotik, ki prestane test (odpornost na želodčno kislino in odpornost na žolčne soli), je zelo pomembno izbrati probiotični izdelek s tehnologijo inkapsulacije. S tako imenovano tehnologijo kapsuliranja se probiotikom doda plast mikrokapsul. Probiotiki morajo opraviti več testov, kot so prebavni encimi, želodčna kislina in žolč, preden vstopijo v črevesje. Zlasti želodčna kislina bo verjetno uničila probiotike. Tehnologija inkapsulacije lahko zaščiti probiotike pred škodljivimi dejavniki v telesu in bolje vstopi v črevesje.
4. Če gre za probiotični prašek, ga je treba zaužiti s toplo vodo pod 45 stopinj Celzija. Če temperatura preseže to temperaturo, se aktivnost probiotikov zmanjša.
5. Probiotike za vzdrževanje črevesja je treba jemati približno pol ure po obroku, da lahko hrana razredči želodčno kislino in poveča možnost preživetja probiotikov. Protialergijske probiotike je treba jemati na prazen želodec, da učinkoviti in aktivni sevi hitro pridejo v črevesje.
6. Zadnja točka je, da se izogibate sočasni uporabi z antibiotiki, ker imajo antibiotiki baktericidni učinek in bodo ubili probiotike.