Zdravstvene koristi probiotikov niso povezane samo z uporabljenimi sevi, temveč so tesno povezane tudi z odmerkom. Znanstvene raziskave kažejo, da lahko probiotiki kolonizirajo, razmnožujejo in izvajajo regulatorne učinke v črevesju le, če jih zaužijemo v zadostnih količinah. To jim omogoča izboljšanje črevesne mikrobiote, spodbujanje prebave in absorpcije hranil ali krepitev imunosti. Vendar se učinkoviti odmerek razlikuje glede na sev. Na primer, nekateri sevi lahko povzročijo pozitivne učinke pri dnevnem vnosu le nekaj sto milijonov živih celic, medtem ko drugi zahtevajo večje količine, da dosežejo opazne koristi.
Za isti sev v določenem razponu je večja verjetnost, da bo večji odmerek prinesel pomembne koristi za zdravje kot nižji odmerek. Vendar to ne pomeni, da je »več vedno bolje«. Preseganje priporočenega odmerka ne bo trajno povečalo učinka in lahko celo povzroči izgubo ali v nekaterih primerih poveča tveganje za nelagodje v prebavilih.
Poleg tega, ker imajo različni sevi različne značilnosti in mehanizme delovanja, preprosta primerjava števila živih celic v izdelku ne kaže njegove splošne učinkovitosti. Bolj znanstveni način za ocenjevanje učinkovitosti probiotikov je sklicevanje na klinične dokaze, ki podpirajo določen sev, in ne le na količino. Pri izbiri izdelkov bi se morali potrošniki osredotočiti na seve s podatki kliničnih raziskav in avtoritativnimi certifikati ter izbrati tiste, ki ustrezajo njihovim individualnim potrebam, namesto da slepo sledijo visokim odmerkom ali golemu številu živih bakterij.